Heinrich Schliemann encontró Troya en 1871 y demostró con su hallazgo que la ciudad era algo más que un mito. El problema fue que se topó con varias ciudades levantadas cada una sobre las ruinas de la anterior en una sucesión que no supo interpretar. El arqueólogo aficionado identificó la segunda, empezando por abajo, como la ciudad de Helena, Príamo y Paris, 'pasándose de largo' unos mil años en el pasado. De hecho, en su excavación 'atravesó' la Troya de Homero, que la mayor parte de los especialistas que estudiaron el yacimiento más tarde situaron en Troya VII, (hacia 1250 aC). Wilhelm Dörpfeld, arqueólogo profesional que había excavado en Olimpia y colaboró con Schliemann en sus últimas campañas para hacerse cargo del yacimiento tras su muerte, identificó nueve niveles superpuestos y fue el primero en proponer que la Troya de Homero estaba entre el sexto y el séptimo.
Excavaciones posteriores han definido hasta una treintena de niveles de ocupaciónque van desde un asentamiento fortificado levantado a partir del 2920 aC hasta una ciudad bizantina del siglo XIV que fue sede episcopal.
La historicidad de la guerra de Troya sigue debatiéndose. Un sector escéptico asegura que no hay evidencias arqueológicas de un conflicto entre aqueos y troyanos. En 'Troya y Homero' (Destino, 2001) Joachim Latacz resumió el estado de la cuestión y concluyó que «en el punto alcanzado hoy por la investigación, aún no podemos decir nada vinculante sobre la historicidad de la guerra de Troya». El yacimiento, en el que todavía se excava, fue declarado Patrimonio de la Humanidad por la Unesco en 1998.
